Der Wettbewerb wurde zu Beginn des Jahres 1998 im Rahmen der "Bildungsoffensive Mathematik Bayern" des bayerischen Kultusministeriums initiiert. Mit dieser Entwicklungsaufgabe war am ISB (heute: Institut für Schulqualität und Bildungsforschung) Max Leppmeier beauftragt worden.
In enger Zusammenarbeit mit Baden-Württemberg konnte im Schuljahr 1998/99 der erste Wettbewerb mit unerwartet hohen Teilnehmerzahlen stattfinden. Bis zum Jahr 2000 hat Rudolf Großmann zusammen mit Paul Jainta den Wettbewerb im Auftrag des Kultusministeriums geleitet. Beide hatten zuvor wesentlich beim Aufbau der Fürther Mathematikolympiade mitgewirkt und hierbei wertvolle Erfahrungen gesammelt.
Im Jahr 2000 übernahm Albrecht Kliem die Leitung des Wettbewerbs. Die vertrauensvolle Zusammenarbeit mit Baden-Württemberg, z.B. im Bereich der Aufgabenerstellung, ist in dieser Zeit für beide Seiten gewinnbringend weiter durchgeführt und ausgebaut worden.
Seit Beginn des Wettbewerbs gibt es neben der Grundfinanzierung durch das Kultusministerium Sponsoren, die es ermöglichen, Preise an die Teilnehmer und an die besonders erfolgreichen Schulen zu vergeben. Dieses Sponsoring wird ermöglicht durch den 1998 gegründeten gemeinnützigen Förderverein Landeswettbewerb Mathematik Bayern e.V.
Seit vielen Jahren gibt es enge Kontakte zu anderen Wettbewerben, insbesondere zum Bundeswettbewerb Mathematik.